Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSQ5

CCM2, Cerebral cavernous malformations 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2Q9BSQ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCM2Q9BSQ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCM2Q9BSQ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCM2Q9BSQ5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCM2Q9BSQ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCM2Q9BSQ5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms