Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ6

CHCHD6, MICOS complex subunit MIC25, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD6Q9BRQ6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHCHD6Q9BRQ6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHCHD6Q9BRQ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHCHD6Q9BRQ6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHCHD6Q9BRQ6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms