Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF8Q9BRL6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SRSF8Q9BRL6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SRSF8Q9BRL6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SRSF8Q9BRL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms