Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLF1Q9BQI6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SLF1Q9BQI6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SLF1Q9BQI6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SLF1Q9BQI6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms