Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BARD1Q99728 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BARD1Q99728 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BARD1Q99728 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARD1Q99728 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms