Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITX2Q99697 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PITX2Q99697 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PITX2Q99697 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PITX2Q99697 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms