Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNKPQ96T60 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNKPQ96T60 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNKPQ96T60 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNKPQ96T60 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PNKPQ96T60 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms