Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CRBNQ96SW2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CRBNQ96SW2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CRBNQ96SW2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CRBNQ96SW2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CRBNQ96SW2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRBNQ96SW2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 340.5 ms