Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB3IPQ96QF0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB3IPQ96QF0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB3IPQ96QF0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB3IPQ96QF0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms