Protein–RNA interactions for Protein: Q96NJ6

ZFP3, Zinc finger protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP3Q96NJ6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP3Q96NJ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP3Q96NJ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP3Q96NJ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP3Q96NJ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP3Q96NJ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZFP3Q96NJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZFP3Q96NJ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZFP3Q96NJ6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZFP3Q96NJ6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZFP3Q96NJ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms