Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CMTM3Q96MX0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CMTM3Q96MX0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CMTM3Q96MX0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms