Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ROBO3Q96MS0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ROBO3Q96MS0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ROBO3Q96MS0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ROBO3Q96MS0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms