Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMCE3Q96MG7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMCE3Q96MG7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMCE3Q96MG7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMCE3Q96MG7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMCE3Q96MG7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMCE3Q96MG7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMCE3Q96MG7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMCE3Q96MG7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMCE3Q96MG7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMCE3Q96MG7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NSMCE3Q96MG7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NSMCE3Q96MG7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NSMCE3Q96MG7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NSMCE3Q96MG7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NSMCE3Q96MG7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms