Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRIMPOLQ96LW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRIMPOLQ96LW4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRIMPOLQ96LW4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRIMPOLQ96LW4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms