Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCHS1Q96JQ0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCHS1Q96JQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DCHS1Q96JQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DCHS1Q96JQ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DCHS1Q96JQ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms