Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHDQ96IW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHDQ96IW2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHDQ96IW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SHDQ96IW2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SHDQ96IW2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms