Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MVB12AQ96EY5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MVB12AQ96EY5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MVB12AQ96EY5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MVB12AQ96EY5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms