Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNFT2Q96EX2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNFT2Q96EX2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNFT2Q96EX2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNFT2Q96EX2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms