Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF31Q96EP0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF31Q96EP0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF31Q96EP0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF31Q96EP0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms