Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPDL1Q96EA4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPDL1Q96EA4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPDL1Q96EA4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPDL1Q96EA4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms