Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB3CQ96E17 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB3CQ96E17 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB3CQ96E17 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3CQ96E17 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3CQ96E17 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms