Protein–RNA interactions for Protein: Q96E14

RMI2, RecQ-mediated genome instability protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMI2Q96E14 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RMI2Q96E14 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RMI2Q96E14 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RMI2Q96E14 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms