Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RMDN1Q96DB5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RMDN1Q96DB5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RMDN1Q96DB5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RMDN1Q96DB5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RMDN1Q96DB5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms