Protein–RNA interactions for Protein: Q96DA2

RAB39B, Ras-related protein Rab-39B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39BQ96DA2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB39BQ96DA2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB39BQ96DA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB39BQ96DA2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB39BQ96DA2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms