Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FAF2Q96CS3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAF2Q96CS3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAF2Q96CS3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAF2Q96CS3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAF2Q96CS3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAF2Q96CS3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAF2Q96CS3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAF2Q96CS3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAF2Q96CS3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms