Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EME1Q96AY2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EME1Q96AY2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EME1Q96AY2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms