Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VOPP1Q96AW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VOPP1Q96AW1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
VOPP1Q96AW1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
VOPP1Q96AW1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms