Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
TRIM52Q96A61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
TRIM52Q96A61 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
TRIM52Q96A61 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC37.65■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
TRIM52Q96A61 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
TRIM52Q96A61 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TRIM52Q96A61 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms