Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC10Q969S8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC10Q969S8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HDAC10Q969S8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDAC10Q969S8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDAC10Q969S8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC10Q969S8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC10Q969S8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms