Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HGDQ93099 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HGDQ93099 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HGDQ93099 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HGDQ93099 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HGDQ93099 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HGDQ93099 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HGDQ93099 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HGDQ93099 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HGDQ93099 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HGDQ93099 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HGDQ93099 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HGDQ93099 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HGDQ93099 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HGDQ93099 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HGDQ93099 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HGDQ93099 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HGDQ93099 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HGDQ93099 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HGDQ93099 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HGDQ93099 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HGDQ93099 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HGDQ93099 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HGDQ93099 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HGDQ93099 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HGDQ93099 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HGDQ93099 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HGDQ93099 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HGDQ93099 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HGDQ93099 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HGDQ93099 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HGDQ93099 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HGDQ93099 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HGDQ93099 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HGDQ93099 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HGDQ93099 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HGDQ93099 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HGDQ93099 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HGDQ93099 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HGDQ93099 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HGDQ93099 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HGDQ93099 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HGDQ93099 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HGDQ93099 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HGDQ93099 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HGDQ93099 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HGDQ93099 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HGDQ93099 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HGDQ93099 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HGDQ93099 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HGDQ93099 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HGDQ93099 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HGDQ93099 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HGDQ93099 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HGDQ93099 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HGDQ93099 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HGDQ93099 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HGDQ93099 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HGDQ93099 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HGDQ93099 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HGDQ93099 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HGDQ93099 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HGDQ93099 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HGDQ93099 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HGDQ93099 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HGDQ93099 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HGDQ93099 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HGDQ93099 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HGDQ93099 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HGDQ93099 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HGDQ93099 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HGDQ93099 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HGDQ93099 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HGDQ93099 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HGDQ93099 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HGDQ93099 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HGDQ93099 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HGDQ93099 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HGDQ93099 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HGDQ93099 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HGDQ93099 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGDQ93099 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGDQ93099 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGDQ93099 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGDQ93099 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGDQ93099 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGDQ93099 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGDQ93099 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGDQ93099 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGDQ93099 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HGDQ93099 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HGDQ93099 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HGDQ93099 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HGDQ93099 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HGDQ93099 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HGDQ93099 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HGDQ93099 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HGDQ93099 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HGDQ93099 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HGDQ93099 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms