Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A1Q93096 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTP4A1Q93096 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTP4A1Q93096 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms