Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RORBQ92753 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RORBQ92753 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RORBQ92753 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RORBQ92753 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RORBQ92753 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RORBQ92753 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RORBQ92753 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RORBQ92753 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RORBQ92753 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RORBQ92753 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RORBQ92753 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RORBQ92753 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RORBQ92753 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RORBQ92753 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RORBQ92753 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORBQ92753 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORBQ92753 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORBQ92753 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORBQ92753 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORBQ92753 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORBQ92753 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORBQ92753 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RORBQ92753 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RORBQ92753 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RORBQ92753 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RORBQ92753 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RORBQ92753 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RORBQ92753 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RORBQ92753 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORBQ92753 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORBQ92753 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORBQ92753 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RORBQ92753 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORBQ92753 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RORBQ92753 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RORBQ92753 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORBQ92753 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORBQ92753 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORBQ92753 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RORBQ92753 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORBQ92753 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORBQ92753 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RORBQ92753 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORBQ92753 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORBQ92753 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORBQ92753 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORBQ92753 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORBQ92753 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORBQ92753 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORBQ92753 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RORBQ92753 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RORBQ92753 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RORBQ92753 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RORBQ92753 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORBQ92753 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORBQ92753 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORBQ92753 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORBQ92753 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RORBQ92753 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORBQ92753 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORBQ92753 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORBQ92753 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORBQ92753 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORBQ92753 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORBQ92753 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORBQ92753 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RORBQ92753 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RORBQ92753 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RORBQ92753 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORBQ92753 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORBQ92753 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORBQ92753 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORBQ92753 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RORBQ92753 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORBQ92753 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RORBQ92753 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RORBQ92753 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORBQ92753 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORBQ92753 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RORBQ92753 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORBQ92753 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORBQ92753 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORBQ92753 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORBQ92753 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORBQ92753 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORBQ92753 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORBQ92753 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RORBQ92753 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORBQ92753 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORBQ92753 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RORBQ92753 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORBQ92753 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORBQ92753 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORBQ92753 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORBQ92753 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RORBQ92753 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RORBQ92753 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RORBQ92753 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RORBQ92753 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms