Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA1Q92743 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA1Q92743 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTRA1Q92743 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTRA1Q92743 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTRA1Q92743 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms