Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX39

LCN9, Epididymal-specific lipocalin-9, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN9Q8WX39 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LCN9Q8WX39 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LCN9Q8WX39 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LCN9Q8WX39 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LCN9Q8WX39 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCN9Q8WX39 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCN9Q8WX39 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCN9Q8WX39 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LCN9Q8WX39 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN9Q8WX39 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN9Q8WX39 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN9Q8WX39 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LCN9Q8WX39 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms