Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UBLCP1Q8WVY7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
UBLCP1Q8WVY7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UBLCP1Q8WVY7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBLCP1Q8WVY7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBLCP1Q8WVY7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBLCP1Q8WVY7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBLCP1Q8WVY7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBLCP1Q8WVY7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBLCP1Q8WVY7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms