Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAVCR2Q8TDQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAVCR2Q8TDQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAVCR2Q8TDQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HAVCR2Q8TDQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HAVCR2Q8TDQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms