Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms