Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLGN4YQ8NFZ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NLGN4YQ8NFZ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NLGN4YQ8NFZ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NLGN4YQ8NFZ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NLGN4YQ8NFZ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms