Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL4

GALNT6, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT6Q8NCL4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GALNT6Q8NCL4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT6Q8NCL4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GALNT6Q8NCL4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GALNT6Q8NCL4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms