Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MFSD9Q8NBP5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MFSD9Q8NBP5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MFSD9Q8NBP5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MFSD9Q8NBP5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MFSD9Q8NBP5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms