Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMER3Q8N944 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER3Q8N944 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMER3Q8N944 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AMER3Q8N944 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AMER3Q8N944 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms