Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00612Q8N6U2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00612Q8N6U2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00612Q8N6U2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms