Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf62Q8N4C0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
C9orf62Q8N4C0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf62Q8N4C0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C9orf62Q8N4C0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms