Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NME8Q8N427 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NME8Q8N427 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
NME8Q8N427 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME8Q8N427 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NME8Q8N427 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME8Q8N427 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NME8Q8N427 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NME8Q8N427 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME8Q8N427 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NME8Q8N427 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME8Q8N427 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NME8Q8N427 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NME8Q8N427 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NME8Q8N427 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NME8Q8N427 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME8Q8N427 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NME8Q8N427 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NME8Q8N427 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME8Q8N427 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NME8Q8N427 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms