Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PHTF2Q8N3S3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PHTF2Q8N3S3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PHTF2Q8N3S3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PHTF2Q8N3S3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms