Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3G9

TMEM130, Transmembrane protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM130Q8N3G9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM130Q8N3G9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TMEM130Q8N3G9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM130Q8N3G9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM130Q8N3G9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM130Q8N3G9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMEM130Q8N3G9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM130Q8N3G9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms