Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00518Q8N0U6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LINC00518Q8N0U6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LINC00518Q8N0U6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
LINC00518Q8N0U6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LINC00518Q8N0U6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms