Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HACE1Q8IYU2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HACE1Q8IYU2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HACE1Q8IYU2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HACE1Q8IYU2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HACE1Q8IYU2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms