Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC71Q8IV32 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC71Q8IV32 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC71Q8IV32 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC71Q8IV32 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms