Protein–RNA interactions for Protein: Q86WK6

AMIGO1, Amphoterin-induced protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1Q86WK6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AMIGO1Q86WK6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
AMIGO1Q86WK6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
AMIGO1Q86WK6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
AMIGO1Q86WK6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms