Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM228AQ86W67 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM228AQ86W67 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM228AQ86W67 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM228AQ86W67 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms